Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprfA2A8L5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms