Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp1bA1Z198 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms