Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trav12-2A0N8N6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms