Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms