Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Limd1Q9QXD8 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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