Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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