Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RabggtaQ9JHK4 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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