Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc47Q9D024 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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