Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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