Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ubxn4Q8VCH8 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms