Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NipblQ6KCD5 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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