Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxa13Q62424 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxa13Q62424 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms