Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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