Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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Ctdnep1Q3TP92 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Ctdnep1Q3TP92 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms