Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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