Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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