Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpl28P41105 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms