Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtprmP28828 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PtprmP28828 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PtprmP28828 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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