Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RxraP28700 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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