Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Eftud2O08810 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Eftud2O08810 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Eftud2O08810 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms