Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
H2-M1F7CXU4 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms