Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn8Q9Z260 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn8Q9Z260 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms