Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Limd1Q9QXD8 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms