Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Rabgef1Q9JM13 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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