Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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