Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SgshQ9EQ08 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms