Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ccdc47Q9D024 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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