Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rprd1bQ9CSU0 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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