Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccer1Q9CQL2 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccer1Q9CQL2 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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