Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg8Q8VE18 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg8Q8VE18 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms