Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CipcQ8R0W1 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms