Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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Usp38Q8BW70 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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Usp38Q8BW70 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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Usp38Q8BW70 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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Usp38Q8BW70 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Usp38Q8BW70 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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