Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NischQ80TM9 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NischQ80TM9 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NischQ80TM9 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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