Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Clec18aQ7TSQ1 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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Clec18aQ7TSQ1 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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Clec18aQ7TSQ1 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Clec18aQ7TSQ1 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Clec18aQ7TSQ1 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms