Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NipblQ6KCD5 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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