Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Pkp4Q68FH0 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Pkp4Q68FH0 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Pkp4Q68FH0 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Pkp4Q68FH0 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Pkp4Q68FH0 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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Pkp4Q68FH0 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Pkp4Q68FH0 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Pkp4Q68FH0 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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