Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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