Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Trim71Q1PSW8 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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