Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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ptchd1Q14B62 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms