Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Hoxd1Q01822 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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