Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RxraP28700 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RxraP28700 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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