Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PdgfraP26618 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PdgfraP26618 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PdgfraP26618 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PdgfraP26618 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PdgfraP26618 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PdgfraP26618 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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