Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Hoxd12P23812 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxd12P23812 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms