Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
DffaO54786 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
DffaO54786 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
DffaO54786 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
DffaO54786 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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DffaO54786 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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DffaO54786 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DffaO54786 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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