Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Eftud2O08810 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Eftud2O08810 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms