Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NebE9Q1W3 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NebE9Q1W3 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms