Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Spocd1B1ASB6 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Spocd1B1ASB6 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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