Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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Grik3B1AS29 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Grik3B1AS29 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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