Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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PtprfA2A8L5 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprfA2A8L5 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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