Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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